A Real Time PCR strategy for the detection and quantification of Candida albicans in human blood

Authors

  • Felipe Delatorre Busser Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, Laboratório de Investigação Médica em Imunologia (LIM 48) https://orcid.org/0000-0002-2211-2690
  • Vivian Caso Coelho Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, Laboratório de Investigação Médica em Imunologia (LIM 48)
  • Claudia de Abreu Fonseca Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, Laboratório de Investigação Médica em Imunologia (LIM 48)
  • Gilda Maria Barbaro Del Negro Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, Laboratório de Investigação Médica em Micologia (LIM 53)
  • Maria Aparecida Shikanai-Yasuda Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, Laboratório de Investigação Médica em Imunologia (LIM 48)
  • Marta Heloisa Lopes Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, Laboratório de Investigação Médica em Imunologia (LIM 48)
  • Marcello Mihailenko Chaves Magri Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, Laboratório de Investigação Médica em Imunologia (LIM 48)
  • Vera Lucia Teixeira de Freitas Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias https://orcid.org/0000-0003-1112-081X

DOI:

https://doi.org/10.1590/S1678-9946202062009

Keywords:

Candida albicans, Candidemia, Detection, Invasive candidiasis, ITS2, Quantitative PCR

Abstract

Candidemia is a significant cause of bloodstream infections (BSI) in nosocomial settings. The identification of species can potentially improve the quality of care and decrease human mortality. Quantitative PCR (qPCR) was evaluated for Candida albicans detection using culture suspensions containing C. albicans, spiked human blood, the cloned qPCR target fragment (ITS2 region) and the results of these assays were compared. The assays showed a good detection limit: C. albicans DNA extracted from yeast (sensitivity 0.2 CFU/µL), spiked human blood (sensitivity 10 CFU/mL), and cloned fragment of ITS2 region (sensitivity 20 target copies/µL). The efficiency of ITS2 fragment-qPCR ranged from 89.67 to 97.07, and the linearity (R2 ) of the standard curve ranged from 0.992 to 0.999. The results showed that this ITS2-qPCR has a great potential as a molecular prototype model for the development of a test to be applied in clinical practice, greatly reducing the time of candidemia diagnosis, which is extremely important in this clinical setting.

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Published

2020-02-04

Issue

Vol. 62 (2020)

Section

Brief Communication

How to Cite

Busser, F. D., Coelho, V. C., Fonseca, C. de A., Del Negro, G. M. B., Shikanai-Yasuda, M. A., Lopes, M. H., Magri, M. M. C., & Freitas, V. L. T. de. (2020). A Real Time PCR strategy for the detection and quantification of Candida albicans in human blood. Revista Do Instituto De Medicina Tropical De São Paulo, 62, e9. https://doi.org/10.1590/S1678-9946202062009