Importation and early local transmission of COVID-19 in Brazil, 2020

Jaqueline Goes de Jesus; Claudio Sacchi; Darlan da Silva Candido; Ingra Morales Claro; Flávia Cristina Silva Sales; Erika Regina Manuli; Daniela Bernardes Borges da Silva; Terezinha Maria de Paiva; Margarete Aparecida Benega Pinho; Katia Correa de Oliveira Santos; Sarah Catherine Hill; Renato Santana Aguiar; Filipe Romero; Fabiana Cristina Pereira dos Santos; Claudia Regina Gonçalves; Maria do Carmo Timenetsky; Joshua Quick; Julio Henrique Rosa Croda; Wanderson de Oliveira; Andrew Rambaut; Oliver G. Pybus; Nicholas J. Loman; Ester Cerdeira Sabino; Nuno Rodrigues Faria

Authors

Jaqueline Goes de Jesus Universidade de São Paulo, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo https://orcid.org/0000-0002-5404-272X
Claudio Sacchi Instituto Adolfo Lutz, Laboratório Estratégico
Darlan da Silva Candido University of Oxford, Department of Zoology https://orcid.org/0000-0002-5080-3130
Ingra Morales Claro Universidade de São Paulo, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo https://orcid.org/0000-0001-8637-2910
Flávia Cristina Silva Sales Universidade de São Paulo, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo https://orcid.org/0000-0002-9048-0030
Erika Regina Manuli Universidade de São Paulo, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo https://orcid.org/0000-0003-2376-8488
Daniela Bernardes Borges da Silva Instituto Adolfo Lutz, Centro de Virologia
Terezinha Maria de Paiva Instituto Adolfo Lutz, Centro de Virologia
Margarete Aparecida Benega Pinho Instituto Adolfo Lutz, Centro de Virologia
Katia Correa de Oliveira Santos Instituto Adolfo Lutz, Centro de Virologia
Sarah Catherine Hill University of Oxford, Department of Zoology https://orcid.org/0000-0002-2995-2596
Renato Santana Aguiar Universidade Federal do Rio de Janeiro
Filipe Romero Universidade Federal do Rio de Janeiro
Fabiana Cristina Pereira dos Santos Instituto Adolfo Lutz, Centro de Virologia
Claudia Regina Gonçalves Instituto Adolfo Lutz, Laboratório Estratégico
Maria do Carmo Timenetsky Instituto Adolfo Lutz, Centro de Virologia https://orcid.org/0000-0001-8317-0539
Joshua Quick University of Birmingham https://orcid.org/0000-0001-6376-871X
Julio Henrique Rosa Croda Ministério da Saúde, Secretaria de Vigilância em Saúde, Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública
Wanderson de Oliveira Ministério da Saúde, Secretaria de Vigilância em Saúde, Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública
Andrew Rambaut University of Edinburgh, Institute of Evolutionary Biology https://orcid.org/0000-0003-4337-3707
Oliver G. Pybus University of Oxford, Department of Zoology https://orcid.org/0000-0002-8797-2667
Nicholas J. Loman University of Birmingham https://orcid.org/0000-0002-9843-8988
Ester Cerdeira Sabino Universidade de São Paulo, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo https://orcid.org/0000-0003-2623-5126
Nuno Rodrigues Faria Universidade de São Paulo, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo https://orcid.org/0000-0002-9747-8822

Keywords:

Public health surveillance, COVID-19, SARS-CoV-2

Abstract

We conducted the genome sequencing and analysis of the first confirmed COVID-19 infections in Brazil. Rapid sequencing coupled with phylogenetic analyses in the context of travel history corroborate multiple independent importations from Italy and local spread during the initial stage of COVID-19 transmission in Brazil.

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Importation and early local transmission of COVID-19 in Brazil, 2020

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